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柑橘類根系發(fā)達。用壓條或扦插方法繁殖的無主根。土壤條件良好時，側(cè)根多而水平分布范圍廣，常有菌根共生，側(cè)根上的細根再生能力強，露出土面的根部易生根蘗。很多種類、品種的枝上具針刺。芽為復(fù)芽。一個葉腋一般萌發(fā)一個新梢，余呈休眠狀態(tài)。新梢停止生長時，頂芽自行凋落，是柑橘類果樹特有的“自剪”現(xiàn)象。這時由先端的一個側(cè)芽代替頂芽作用，因此枝條常呈扭曲狀態(tài)。未萌發(fā)的芽可多年保持萌發(fā)能力。生產(chǎn)上常利用這個特性，通過刺激隱芽萌發(fā)來修補殘缺樹冠或行老樹更新。復(fù)葉，由 3片小葉組成，或為“單身復(fù)葉”。除枳為落葉性外，柑橘屬及金柑屬均為常綠樹。******花，芳香，蜜腺發(fā)達。有單花和花序兩類。花器發(fā)育不全現(xiàn)象較為常見，容易產(chǎn)生少核或無核的果實；有時也有單性結(jié)實。
枳在冬季有明顯的休眠期，金柑屬和柑橘屬幾乎周年均有生長活動。一般每年抽梢3～4次。春梢抽發(fā)較整齊，數(shù)量***多，其中一部分是當年結(jié)果枝；夏梢是培養(yǎng)幼樹樹冠的主要枝梢；秋梢大多是次年的結(jié)果母枝。在春梢的基礎(chǔ)上可再抽生二次、三次梢。冬梢在生產(chǎn)上無意義，宜及早抹除。多數(shù)種類每年春季開花1次，但檸檬、枸櫞周年均可開花結(jié)果，金柑屬從6～7月開花后大約每隔一個月左右連續(xù)開花2～3次，各次花均能結(jié)實。柑橘的花量大，但著果率不高。一般自花傳粉受精，但沙田柚需要異花傳粉才能提高產(chǎn)量。從謝花到果實成熟，需時6～14個月，因種類、品種而異。
果實由合生心皮發(fā)育而成，多肉多漿特稱“柑果”。外、中果皮緊貼，組成韌性的果皮，外果皮含有很多油胞；中果皮呈海綿狀，與外果皮之間界限難分；內(nèi)果皮形成囊瓣（即子房室），又名瓤囊，囊瓣內(nèi)著生紡錘狀的多汁突起物，稱汁胞，是柑橘的主要食用部分（見圖）。種子通常為多胚性，只有一個有性胚，余為未經(jīng)受精、從珠心細胞產(chǎn)生的無性胚，稱珠心胚；少數(shù)種類為單胚性。多胚性種子萌發(fā)時，有性胚往往敗育，實生后代多由無性胚發(fā)育而來，能保持母該品種的基本性狀，但也給雜交育種帶來困難。染色體數(shù)一般為2n=18。種間、屬間容易雜交，枝芽易生變異（芽變）。嫁接親和性一般良好，有可能提供廣泛的砧穗組合，滿足生產(chǎn)或其他特殊用途的需要。